1、靠見效速度評價商品好壞微生物肥料效果的發(fā)揚與微生物菌群繁衍速度、菌群數(shù)量關(guān)系緊密，菌群生長存在周期，這一點是與化學(xué)肥料和植物調(diào)理劑的區(qū)別，這也就出現(xiàn)了微生物肥料速效性不如化學(xué)肥料與植物調(diào)理劑的現(xiàn)象。見效慢并不意味著微生物是無效果的，能在較長工夫內(nèi)就可以看到作物長勢清楚改善的品種也未必是好的山東菌肥或菌劑，其中也不乏一些添加了植物調(diào)理劑的品種。

2、種類混亂，分不清運用的是菌劑還是山東菌肥微生物肥料包括復(fù)合微生物肥料和生物無機(jī)肥：復(fù)合微生物肥料是有益微生物與營養(yǎng)物質(zhì)復(fù)合而成的活菌制品；生物無機(jī)肥是有益微生物與經(jīng)無害化處置的無機(jī)物料（畜禽糞便、農(nóng)作物秸稈等）復(fù)合而成的活菌制品。菌劑、菌肥的區(qū)別在于商品中營養(yǎng)物質(zhì)及無機(jī)物料的含量，運用中需結(jié)合理論需求選擇對路商品。

3、以爲(wèi)一種商品中菌的種類越多、菌種數(shù)量越大越好微生物肥料的運用效果會遭到不同菌種生長習(xí)性的影響，盲目的復(fù)合，極易構(gòu)成菌種間的拮抗，影響效果發(fā)揚。數(shù)量不能代表全部，不但要看菌數(shù)量，還要看有效活菌的數(shù)量，運用后起作用的只需活菌，有益活菌數(shù)量越大效果會表現(xiàn)越好。影響商品運用效果的要素除了菌的種類及數(shù)量外，菌的純度至關(guān)重要，當(dāng)商品中霉菌雜菌數(shù)及雜菌率超標(biāo)時也會影呼使用，市場上少數(shù)不合格商品中會含有致病菌，本意是用有益菌修復(fù)土壤，運用了不合格品種，反而會惹起致病菌繁衍，招致病害發(fā)作。

4、以爲(wèi)運用一次就可以，一次運用作用可持續(xù)多年部分微生物施入土壤后會大批繁衍，當(dāng)數(shù)量抵達(dá)一定程度后就會成爲(wèi)優(yōu)勢菌群，但隨著外部環(huán)境的改動，如化肥的超量運用、殺菌劑的運用、高溫悶棚等都會招致有益菌死亡，從而影響有益菌群在土壤微生物系統(tǒng)中的地位，要繼續(xù)堅持有益菌群的地位，就需求在作物的生暫時多次運用微生物肥料來補充有益菌。

5、不注重菌的種類，以爲(wèi)一種菌可以處置多種成果菜農(nóng)在選購微生物肥料時只注重是不是含菌，而不關(guān)注菌的種類，缺乏對癥用菌的看法，運用了不對癥的菌品種，商品效果難以發(fā)揚，難以抵達(dá)用戶目的。現(xiàn)階段在農(nóng)業(yè)部獲得登記的微生物品種有根瘤菌菌劑、固氮菌菌劑、解磷類微生物菌劑、硅酸鹽微生物菌劑、光合細(xì)菌菌劑、無機(jī)物料腐熟劑、促生菌劑、菌根菌劑、生物修復(fù)菌劑。

6、微生物肥料可以替代化肥土壤肥力由生物肥力、化學(xué)肥力、物理肥力三部分組成，運用微生物肥料后能提高土壤的生物肥力，可以間接促退步學(xué)肥力和物理肥力的提高。運用微生物肥料不能完全替代化肥，但可以提高肥料使用率，添加部分化肥的投入。

二、微生物肥施用上的誤區(qū)：不只在對微生物肥料看法上存在誤區(qū)，在運用進(jìn)程中也異常存在誤區(qū)，而在運用時沒有避開這樣的誤區(qū)就會構(gòu)成微生物肥料沒有效果。運用中存在的誤區(qū)有以下三個方面：

1、與殺菌劑混用，降低活性微生物肥料中含有活菌成分，將微生物肥料與殺細(xì)菌藥劑混合運用且長時間放置，極易影響菌的活性降低并構(gòu)成部分菌死亡。

2、注重運用，輕視運用量運用微生物肥料商品能取得好的效果，前提是要用足量。土壤中的微生物種類單一、數(shù)量龐大，接種的外來有益菌要構(gòu)成優(yōu)勢菌群，需求閱歷來自環(huán)境的考驗和土壤原有微生物的競爭，爲(wèi)了促進(jìn)有益菌的繁衍需求人爲(wèi)創(chuàng)造有利于有益菌生長的條件，如改良酸化土壤，調(diào)整土壤酸堿度；增施無機(jī)肥，提高土壤物理肥力；添加微生物菌的數(shù)量等。

3、運用時期掌握不當(dāng)多數(shù)微生物怕紫外線、高溫，所以土壤表層撒施、高溫強光下噴霧運用一定沒有效果。做底肥、溝施、穴施、灌根運用時采取局部用肥的方法更有利于肥效的發(fā)揚。不同類型的微生物菌劑不要亂用。比如用于糞肥發(fā)酵的菌劑中主要含量嗜熱菌、厭氧菌等，可以順應(yīng)糞肥發(fā)酵時發(fā)作的高溫環(huán)境，而運用普通的菌劑或菌肥不只沒有效果還會構(gòu)成資金糜費。